Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad7O35253 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad7O35253 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad7O35253 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad7O35253 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad7O35253 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smad7O35253 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad7O35253 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms