Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Nedd9O35177 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Nedd9O35177 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Nedd9O35177 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Nedd9O35177 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Nedd9O35177 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Nedd9O35177 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nedd9O35177 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
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