Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CckarO08786 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CckarO08786 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CckarO08786 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CckarO08786 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CckarO08786 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CckarO08786 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CckarO08786 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CckarO08786 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CckarO08786 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CckarO08786 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CckarO08786 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CckarO08786 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckarO08786 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckarO08786 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckarO08786 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckarO08786 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckarO08786 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckarO08786 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckarO08786 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckarO08786 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckarO08786 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckarO08786 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckarO08786 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckarO08786 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckarO08786 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckarO08786 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckarO08786 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CckarO08786 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CckarO08786 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CckarO08786 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CckarO08786 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CckarO08786 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CckarO08786 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CckarO08786 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CckarO08786 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CckarO08786 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CckarO08786 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CckarO08786 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CckarO08786 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CckarO08786 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CckarO08786 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CckarO08786 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CckarO08786 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CckarO08786 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CckarO08786 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckarO08786 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckarO08786 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckarO08786 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckarO08786 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckarO08786 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckarO08786 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckarO08786 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckarO08786 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckarO08786 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckarO08786 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckarO08786 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CckarO08786 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CckarO08786 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckarO08786 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckarO08786 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckarO08786 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckarO08786 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckarO08786 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckarO08786 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckarO08786 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckarO08786 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckarO08786 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CckarO08786 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckarO08786 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckarO08786 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckarO08786 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckarO08786 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CckarO08786 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CckarO08786 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CckarO08786 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CckarO08786 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CckarO08786 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CckarO08786 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CckarO08786 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CckarO08786 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckarO08786 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckarO08786 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckarO08786 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckarO08786 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckarO08786 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CckarO08786 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CckarO08786 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckarO08786 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckarO08786 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckarO08786 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckarO08786 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CckarO08786 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CckarO08786 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CckarO08786 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CckarO08786 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CckarO08786 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CckarO08786 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CckarO08786 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CckarO08786 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms