Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna3O08545 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna3O08545 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna3O08545 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna3O08545 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna3O08545 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna3O08545 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna3O08545 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna3O08545 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna3O08545 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna3O08545 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms