Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ59

Gm3383, Predicted gene 3194, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3383J3QQ59 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3383J3QQ59 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm3383J3QQ59 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3383J3QQ59 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3383J3QQ59 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3383J3QQ59 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3383J3QQ59 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3383J3QQ59 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3383J3QQ59 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3383J3QQ59 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3383J3QQ59 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3383J3QQ59 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3383J3QQ59 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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