Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8356J3QPD3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8356J3QPD3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms