Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lipo1J3QME6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lipo1J3QME6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lipo1J3QME6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lipo1J3QME6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lipo1J3QME6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lipo1J3QME6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lipo1J3QME6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lipo1J3QME6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms