Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Gm20828J3KMI7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Gm20828J3KMI7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Gm20828J3KMI7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Gm20828J3KMI7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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