Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdh18E9Q9Q6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms