Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc78D3Z5T1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc78D3Z5T1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms