Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hfm1D3Z4R1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Hfm1D3Z4R1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Hfm1D3Z4R1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms