Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brpf3B2KF05 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms