Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Herc3A6H6S0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Herc3A6H6S0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms