Protein–RNA interactions for Protein: A2AVA0

Svep1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1A2AVA0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Svep1A2AVA0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Svep1A2AVA0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Svep1A2AVA0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Svep1A2AVA0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Svep1A2AVA0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Svep1A2AVA0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Svep1A2AVA0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Svep1A2AVA0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Svep1A2AVA0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Svep1A2AVA0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Svep1A2AVA0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Svep1A2AVA0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Svep1A2AVA0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Svep1A2AVA0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Svep1A2AVA0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Svep1A2AVA0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Svep1A2AVA0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Svep1A2AVA0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Svep1A2AVA0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Svep1A2AVA0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Svep1A2AVA0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Svep1A2AVA0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Svep1A2AVA0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Svep1A2AVA0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Svep1A2AVA0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Svep1A2AVA0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Svep1A2AVA0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Svep1A2AVA0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Svep1A2AVA0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Svep1A2AVA0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Svep1A2AVA0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Svep1A2AVA0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms