Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms