Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms