Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knop1Q9Z2Q2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1291 ms