Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubl3Q9Z2M6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubl3Q9Z2M6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms