Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited4Q9WUL8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms