Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema6cQ9WTM3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms