Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms