Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpc1Q9QZF2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms