Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Six6Q9QZ28 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Six6Q9QZ28 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms