Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms