Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dkk3Q9QUN9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms