Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH6

Txnrd1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd1Q9JMH6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Txnrd1Q9JMH6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Txnrd1Q9JMH6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Txnrd1Q9JMH6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms