Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpa33Q9JKA5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms