Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddx20Q9JJY4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx20Q9JJY4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx20Q9JJY4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms