Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms