Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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