Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4bQ9ES61 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4bQ9ES61 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms