Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irx6Q9ER75 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irx6Q9ER75 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms