Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stx12Q9ER00 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx12Q9ER00 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms