Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms