Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT5

Sdf2, Stromal cell-derived factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2Q9DCT5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdf2Q9DCT5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sdf2Q9DCT5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms