Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ergic1Q9DC16 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms