Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smim23Q9DAL0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms