Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms