Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Speer4f1Q9D5Q6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms