Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D3J9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D3J9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D3J9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D3J9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D3J9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D3J9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D3J9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D3J9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D3J9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D3J9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D3J9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms