Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx20Q9D2Y5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx20Q9D2Y5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx20Q9D2Y5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx20Q9D2Y5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx20Q9D2Y5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx20Q9D2Y5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx20Q9D2Y5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms