Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I8

Mrto4, mRNA turnover protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrto4Q9D0I8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrto4Q9D0I8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrto4Q9D0I8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms