Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmem50aQ9CXL1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem50aQ9CXL1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms