Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms