Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.9 ms