Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn6Q99PL6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn6Q99PL6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms