Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms