Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Pcgf6Q99NA9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pcgf6Q99NA9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms