Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ms4a6bQ99N09 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6bQ99N09 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms