Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms