Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BrapQ99MP8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BrapQ99MP8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms